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编译服务: 新发突发疾病(新型冠状病毒肺炎) 编译者: 蒋君 编译时间: Feb 14, 2020 点击量: 862

为了调查中国及其他地区近期2019-nCoV爆发的时间起源、遗传多样性和传播动态,从中国、泰国和美国采样了总共32个病毒株基因组进行了分析,采样日期为2019年12月24日至2020年1月23日。进行了系统发育对、传播网络和基因组序列的相似图谱分析。基于相似图谱分析,随着时间的推移,树状信号的增加(从0到8.2%、18.2%和25.4%)可能表明人类宿主中2019-nCoV的遗传多样性的增加。我们使用贝叶斯推断框架确定了三个系统发生群集,并使用传输网络分析确定了三个传输群集,使用上述2019-nCoV病毒株基因组序列通过两种方法仅识别了一个群集。每个地点每年2019-nCoV的估计平均进化速率为1.7926×10-3至1.8266×10-3替换。根据我们的研究,进行流行病学调查和基因组数据监视可以指导预防工作,以实时减少2019-nCOV传播,从而对公共卫生产生积极影响。

 

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