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编译服务: 新发突发疾病(新型冠状病毒肺炎) 编译者: 蒋君 编译时间: Feb 14, 2020 点击量: 841

Genome Detective是一个基于Web的用户友好型软件应用程序,可以快速准确地从下一代测序数据集中组装所有已知的病毒基因组。此应用程序允许以FASTA格式从组装的基因组中鉴定系统发生簇和基因型。自2019年发布以来,我们已经为导致大规模爆发的新兴病毒生产了许多分型工具,例如巴西的寨卡和黄热病病毒。在这里,我们介绍了基因组侦探冠状病毒分型工具,该工具可以准确识别在中国和世界各地分离的新型冠状病毒(2019-nCoV)序列。该工具每次提交最多可以接受2,000个序列,对新的完整基因组序列的分析大约需要一分钟。该工具已通过来自十个冠状病毒物种的数百个全基因组进行了测试和验证,并正确分类了所有与SARS相关的冠状病毒(SARSr-CoV)和所有可用于2019-nCoV的公共数据。随着疫情在全球范围内的扩展,该工具还可以跟踪新的病毒突变,这可能有助于加速新型诊断方法,药物和疫苗的开发。

 

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