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编译服务: 人类遗传资源和特殊生物资源流失 编译者: yanyf@mail.las.ac.cn 编译时间: Feb 25, 2019 浏 览 量: 29

当你想到合成生物学,硅谷可能是你首先想到的地方。但是,让我们来看看太平洋西北沿岸约800英里的西雅图吧:西雅图不仅可以说是美国最美丽的城市之一,它在生物技术领域的排名也在不断攀升。这是为什么。

西雅图的生物技术产业拥有顶尖的研究人员。

在西雅图,越来越多的学术研究人员把他们的专业知识用于工业,或者自己成为企业家。举个例子:总部位于西雅图的蛋白质设计初创公司Arzeda,在2018年跻身享有声望的全球清洁技术百强私营清洁技术公司之列。该公司由计算生物学家亚历克斯·赞格里尼、丹妮拉·贾尔斯、埃里克·阿尔托夫和大卫·贝克共同创立。2008年,他们在华盛顿大学(UW)与加州大学洛杉矶分校、斯克里普斯分校、弗雷德·哈奇以及苏黎世ETH的一个有机化学实验室合作进行了酶设计的革命性研究。他们决定用他们的研究来解决农业和商业生物技术领域的现实问题,用可持续的、可负担得起的替代品替代成千上万种有害的日常化学物质。Arzeda团队的成员大多拥有化学、生物化学或微生物学博士学位,他们通过设计定制的蛋白质和酶来实现这一目标,这些蛋白质和酶可以在阳光下为任何目的定制,而不需要化石燃料。

尤以华盛顿大学蛋白质设计研究所(IPD)为例,它是具有工业和全球健康意识的生物技术的金矿。Open Philanthropy Project去年向IPD提供了其有史以来最大的科研拨款,超过1100万美元,用于开发一种通用流感疫苗。IPD的学者们,包括IPD主任和Arzeda的联合创始人戴维·贝克(David Baker)在内,利用在那里获得的研究成果,创建并支持了该地区其他几家主要成功的私营企业。这些包括A-Alpha Bio、Cyrus生物技术、PvP生物制剂、Sana生物技术和新白蛋白疗法。这些公司几乎什么都能做——无论是开发腹腔疾病的治疗方法,将工程细胞输送给人类患者,还是使用闪电般的软件寻找新药。

西雅图生物技术是一项团队运动。

西雅图什么都有——不管你是生物学家、化学家、数据科学家、电气工程师,还是别的什么人。华盛顿大学合成生物学中心(CSB)是来自各个领域的科学家跨学科中心的又一个完美例子。他们的首要信息是:合作。Eric Klavins是一名电气工程师,他的实验室将生物学和工程学结合起来,重新设计基因、细胞甚至整个生物体之间的通信系统。CSB也是生物化学家和Arzeda联合创始人David Baker的家,还有一大批获奖的化学工程师、基因组科学家、病理学家、生物化学家和癌症生物学家共同努力,使他们的合成生物学研究成为业界最好的。

Eric Klavins教授目前的项目包括用工程细菌和酵母合成多细胞系统,以及实验室自动化。

UW在研究领域一直处于领先地位,他们将这归功于他们的合作文化,无论是在UW内部还是与世界各地的合作伙伴。医学研究也参与其中——例如,在西雅图儿童医院,研究人员正与华盛顿大学和弗雷德·哈奇癌症研究中心的同事合作,利用纳米技术研究脑肿瘤。

啤酒爱好者欢迎!

西雅图是手工啤酒爱好者的天堂,拥有数十家啤酒厂,而且还在不断增加——但这种受人喜爱的饮料不仅仅是用来饮用的。啤酒也是西雅图生物科技文化的根基。Arzeda的技术直接来自酿造啤酒的过程:酵母发酵。通过以不同的方式改变这一过程,合成生物学家可以发酵糖和农业废料等可再生资源,并将它们转化为任何数量的有价值的化学物质。利用先进的计算生物学设计,这些化学物质可以大规模生产,用于生物燃料和可持续发展的橡胶。

这种关系是双向的。微生物学家和分子遗传学家肖恩·斯莱特是斯莱特啤酒实验室的创始人,他利用自己20多年的实验室经验(当然,还有对啤酒的热爱)与啤酒酿造商合作,帮助他们酿造独特、高品质的啤酒。他曾在西雅图一家藻类生物燃料公司担任菌株工程师和合成生物组经理,现在他正在学习成为一名成熟的啤酒侍酒师。

这家啤酒实验室由Sound Bio运营,这是一家位于华盛顿州西雅图的初创公司和生物技术爱好者的社区实验室。

西雅图是女性在科技领域的中心。

西雅图的生物技术产业在支持女性从事科学和工业方面一直处于领先地位。生物妇女组织(WIB)是由该地区一些顶级制药、生物技术公司、非营利组织和学术机构的专业人员组成的,其赞助者包括总部位于西雅图的领先公司,如Juno Therapeutics、Omeros和Adaptive Biotechnologies。

女性科学协会(AWIS)是另一个总部位于西雅图的组织,致力于让女性和女孩参与STEM,包括蓬勃发展的生物技术行业。该组织拥有许多企业赞助商,包括爱思伟尔(Elsevier)和MedImmune,后者是生物制药巨头阿斯利康(AstraZeneca)的生物制剂研发部门。卡斯卡迪亚的女性创业空间每年都在改善,因为越来越多的女性创业者从更多的女性投资者那里获得资金。由德勤(Deloitte)、帕金斯•科尔(Perkins Cole)、斯宾塞•斯图尔特(Spencer Stuart)和Madrona Venture Group运营的女性入职培训项目,重点是让太平洋西北部地区的女性进入企业董事会,尤其是在科技行业。

科技巨头们也参与其中。

世界需要生物研究,科技巨头们知道这一点。以西雅图地区的科技巨头微软为例,在过去的十年里,微软越来越多地参与到计算生物学的研究中,加入到分子编程、合成生物学和干细胞的研究中来。他们的跨学科团队什么都做,无论是为生物设备编程,设计DNA分子电路,还是利用计算来观察免疫系统如何识别病毒。

在一家名为“水族馆”的合作初创公司中,UW的埃里克·克拉文斯(Eric Klavins)与数据巨头英特尔(Intel)合作设计了一款名为“智能湿实验室助手”(smart Wet Lab Assistant)的智能分析系统,该系统可以跟踪在实验室中进行的研究。他们的目标是使合成生物学研究可复制、数字化、完全优化和无错误——这对我们这些易犯错的人类来说通常是一个巨大的要求。该系统将允许基于云的研究数据和协议,这些数据和协议比传统的实验室笔记本更可靠。

对西雅图的科学家来说,机会无处不在。

西雅图已经蓬勃发展的科技产业——想想亚马逊(Amazon)和微软(Microsoft)等大名鼎鼎的公司——让这里成为科学家们享受乐趣的天然场所,各种可能性是无穷无尽的。根据房地产报告,过去几年,西雅图的科技业就业增长速度超过了包括旧金山湾区在内的美国其他所有中心。西雅图的科学家可以在许多私营公司中找到成功的案例,比如Juno Therapeutics, Bellwether Bio, Fenologica,或Lumen Bioscience,更不用说从UW的IPD派生出来的许多创业公司了。在这些公司里,他们可以做任何事情,从开发癌症的前沿诊断,到生产不含葡萄的葡萄酒。

这些私营企业也注重团队合作——分子科技公司Zymergen最近从湾区扩张到了西雅图,为从农业到医疗保健的各种行业开发了开拓性的技术。他们通过将基因组科学家、微生物学家、软件工程师和数据科学家的人才整合成一个大的梦之队来实现这一目标。他们的投资者之一,生物经济资本,已经投入了数百万美元给那些为现代生物技术铺平道路的公司。该公司董事总经理兼物理学家罗布•卡尔森(Rob Carlson)已与机械工程师、其他科学家和策略师联手,确定哪些公司将在这个快速增长的市场蓬勃发展。

不管怎么说,硅谷可能是生物技术最知名的地方,但不可否认的是,西雅图的合成生物学空间公司(synthetic biology space)是另一个领头羊。伦敦金融城应该开始为自己打造一个品牌——或许是硅声?

  
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