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编译服务: 结核病防治 编译者: 李阳 编译时间: Sep 19, 2016 浏 览 量: 3

溯源调查并辅以基因分型分析被认为是了解结核病人与人间传播状况的一项重要手段。然而目前仍不清楚结核杆菌全基因组测序对结核病传播的指导作用及对不同人群、高危人群和跨结核菌株谱系的适用情况。基于此,来自伦敦帝国学院的3位研究人员以常规的流行病学为金标准,对全基因组测序用于监测结核病近期传播状况的灵敏度和特异性进行了系统综述,并探讨了全基因组测序能够鉴定出之前未被发现的传播事件,其相关成果于2016年3月10日发表在Tuberculosis上。

该项研究基于系统综述与meta分析组首选报告项目(PRISMA)标准进行,采用复合检索策略搜集3个在线数据库中2005年1月1日至2014年11月30日间收录的所有相关文献,并根据特定标准对数据进行提取。

研究一共纳入12篇文献,发现全基因组测序相较于常规的基因分型具有更高的分辨能力,且能监测到流行病学调查未发现的传播事件;临界值<6的结核杆菌菌株间SNPs可以预测近期结核病的传播;纳入的研究均未对全基因组测序和常规基因分型进行头对头式比较。此外,研究还提出了全基因组测序研究的最低报告标准并考虑了质量控制参数。

  
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