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编译服务: 转基因生物新品种培育 编译者: Zhao 编译时间: May 24, 2017 浏 览 量: 8

【研究意义】单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)是指在基因组水平上单核苷酸的变异, 这种变异发生在不同个体的种、品种以及染色相对应的序列间。植物中, SNP分布广, 具有分辨率高和共显性等特点, 建立基于SNP标记的基因分型体系是进行目标性状快速定位的基础。【前人研究进展】近年来, 随着二代测序技术的不断进步和完善, SNP分析被广泛应用于植物的遗传多样性、系统进化分析、全基因组关联分析、遗传图谱构建等研究中, 丰富了分子标记类型, 是迄今为止多态性最高的分子标记。用于SNP位点鉴定有Sanger测序、Tilling技术、单链构象多态性(SSCP)、SNP芯片、二代测序等一系列的方法。而高分辨率熔解曲线(high resolution melting, HRM)分析技术是基于研究高温度下双链DNA的分离, 进而确定PCR扩增子的遗传变异, 被广泛应用于小麦、水稻、苹果和梨等作物的SNP、Indel和SSR基因分型研究。在桃上, 许多性状基因的精细定位均采用了SNP标记技术。如桃分枝角度基因[20]和桃矮化基因。自发现一个变异单株SD9238以来, 开展了相关的研究工作, 明确了该半矮生性状受显性单基因控制。后续研究发现该温度调控该类型桃节间长度并决定植株高度, 命名该类型桃为温度敏感半矮生桃(Temperature-sensitive semi-dwarf for Prunus Persica, PpTssd)。【本研究切入点】尽管果树上已经完成了苹果、草莓、梨以及桃等多个物种全基因序列测定, 获得了大量的SNP信息, 但是仍缺少快速、低成本、准确的SNP分型技术。同时, 获得与桃Tssd紧密连锁的SNP标记是进行目标性状分子鉴定的前提。【拟解决的关键问题】本研究拟从影响HRM基因分型的主要因子Mg2+浓度和DNA模板入手, 确定基因分型合适的浓度区间, 同时采用杂交群体后代在4种不同类型SNP中进行基因分型验证, 建立不同SNP基因分型的技术体系, 可为后续利用HRM技术进行基因定位、品种鉴定以及遗传多样性评价等提供技术支撑。同时, 基于此技术, 本研究获得了与桃目标性状紧密连锁的SNP, 为建立目标性状的分子鉴定体系奠定基础。

  
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