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  • 摘要:

    在这项回顾性研究中,我们回顾了2020年1月18日至2020年2月2日来自中国四个中心的121例冠状病毒病19型(COVID-19)感染患者的胸部CT表现,探讨了症状出现与最初CT扫描的间隔时间(即早期0-2天(36例患者),中期3-5天(33例患者),晚期6-12天(25例患者))。COVID-19感染的 影像学标志是双侧和外周玻璃液镜和合并肺部混浊。 值得注意的是,早期患者中有20/36(56%)的CT正常。 随着症状发作时间的延长,CT表现更加频繁,包括实变,双侧和周围性病变,更大的全肺受累,线性混浊,“疯狂铺路”模式和“反向晕轮”征。 在10/36早期患者(28%),25/33中级患者(76%)和22/25晚期患者(88%)中观察到双侧肺受累。

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  • 摘要:

    2020年1月,招募了5例发烧和呼吸道症状的患者,他们入选了中国安阳市安阳市第五人民医院和1名无症状家庭成员。该研究得到当地机构审查委员会的批准,并获得了所有患者的书面知情同意。对患者记录进行了详细分析。所有患者均接受了胸部CT检查。使用鼻咽拭子(小说冠状病毒PCR荧光诊断试剂盒,BioGerm Medical Biotechnology)对COVID-19核酸进行实时逆转录酶聚合酶链反应(RT-PCR)测试。

    在中国安阳,由5名COVID-19肺炎患者组成的家族集群在症状发作之前与从武汉流行病中心迁出的无症状家庭成员进行了接触。事件序列表明冠状病毒可能是由无症状携带者传播的。患者1的潜伏期为19天,虽然很长,但在报告的0到24天范围内。她的第一次RT-PCR结果为阴性;已观察到与试剂盒的质量,收集的样品或测试性能有关的假阴性结果。RT-PCR已广泛应用于诊断病毒学中,并且几乎没有产生假阳性结果。因此,她的第二次RT-PCR结果不太可能是假阳性,并被用于确定冠状病毒引起COVID-19的感染。

    先前的一项研究报道了一名无症状的10岁男孩COVID-19感染,但他的胸部CT异常。如果重复本报告中假定无症状携带者传播的发现,则预防COVID-19感染将具有挑战性。无症状携带者获得并传播导致COVID-19的冠状病毒的机制需要进一步研究。

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  • 摘要:

    截至2019年12月,中国武汉报道了一种名为COVID-2019的新型病毒,可??导致许多严重的肺炎病例。病毒知识有限,尤其是关于COVID-2019的发病机理。已对COVID-2019的开放阅读框架1ab(ORF1ab)进行了分析,以证明存在由病毒选择性压力引起的突变。对于选择性压力分析,采取了快速无约束贝叶斯近似(FUBAR)。SwissModel和HHPred服务器已经完成了同源性建模。通过TMHMM,MEMSAT和MEMPACK工具测试了冠状病毒ORF1ab nsp2和nsp3中跨膜螺旋段的存在。使用PyMOL对三维结构进行了分析和显示。

    FUBAR分析显示在正选择压力下存在潜在位点(p值<0.05)。COVID-2019中的723位具有丝氨酸而不是甘氨酸残基,而在氨基酸1010位具有脯氨酸而不是异亮氨酸。在2416个部位(55%)普遍存在阴性选择(p <0.05)。与SARS和Bat SARS样冠状病毒相比,正选择压力可以解释该病毒的某些临床特征。稳定突变落在nsp2蛋白的内体相关蛋白样结构域中,可以解释COVID-2019高传染性的能力,而nsp3蛋白中不稳定的突变则可能暗示了将COVID-2019与SARS区别开的潜在机制。这些数据可能有助于进一步调查,以确定潜在的治疗目标或疫苗策略,特别是在流行病正在蔓延的实际时刻,科学界正在努力丰富关于这种新病毒病原体的知识。

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  • 摘要:

    世界卫生组织(WHO)已宣布2019年新型冠状病毒(2019-nCoV)感染暴发是全球卫生紧急情况。 当前,没有有效的抗2019-nCoV药物。 2019-nCoV和SARS的3CL蛋白酶的序列同一性为96%,这为基于结构的药物重新定位(SBDR)提供了坚实的基础。 基于SARS 3CL蛋白酶的X射线晶体结构,我们构建了2019-nCoV 3CL蛋白酶的3D同源结构。 基于此结构和SARS 3CL蛋白酶抑制剂的现有实验数据集,我们开发了基于机器学习和数学的SBDR模型,以筛选药库中已获得美国食品药品监督管理局(FDA)批准的1465种药物。 我们发现许多FDA批准的药物对2019-nCoV可能具有很高的效力。

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  • 摘要:

    本研究旨在通过重构潜在的传播动态来估计中国武汉市2019-nCov的传播能力和毒力。方法:我们采用统计方法和公共流行病学数据集,计算新型冠状病毒相关的传播性和严重性的估算值。为了进行估算,我们使用了每天在实验室确认的武汉市nCov病例和死亡的系列数据,以及在政府包机航班上从武汉市撤离的日本人的流行病学数据。我们发现,中国武汉市2019-2020年基本传染指数(R)的高达7.05;1月23日之后增强了公共卫生干预措施,武汉市的R值已降至3.24,武汉市的感染总数(即累计感染)估计为983006,增加感染者的比例至9.8%。我们还发现,最新的粗感染死亡率(IFR)和经过时间延迟调整的IFR分别为0.07%和0.23%,比4.0%的原始病死率小几个数量级。结论:我们使用生态模型方法估算了2019-2020年中国武汉市2019-nCov的可传播性和毒力的主要流行病学参数。我们的方法的强大之处在于能够从监视系统收集的部分观察结果中推断出具有不确定性的流行病学参数。

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  • 摘要:

    为了鉴定2019-nCoV的病毒传播能力,我们比较了蛋白酶诱导的2019-nCoV和SARS-CoV之间的刺突蛋白裂解能力。通过蛋白质序列匹配和结构比较,我们发现了675-QTQTNSPRRARSVAS-679这个关键序列介导2019-nCoV刺突蛋白裂解。680-SPRR-683片段在表面上添加了两个精氨酸水解位点(R682和R683),并形成了用于蛋白酶识别的环。分子对接是基于跨膜丝氨酸蛋白酶(TMPRSS),这是冠状病毒裂解中的主要蛋白酶。 ACE2和TMPRSSs在吸收性肠上皮细胞,食道上皮细胞和肺AT2细胞中高度共表达。总而言之,这项研究为2019-nCoV的病毒感染性增加提供了生物信息学证据,并表明肺泡,肺小肠上皮和食道上皮是潜在的靶组织。由于TMPRSS在2019-nCoV感染中的重要作用,跨膜丝氨酸蛋白酶抑制剂可能是2019-nCoV感染的潜在抗病毒治疗选择。

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  • 摘要:

    冠状病毒是导致包括人类,哺乳动物,鱼类和禽类在内的许多宿主严重呼吸,肠道和全身感染的众所周知的原因。在2002-2003年出现严重急性呼吸系统综合症冠状病毒(SARS-CoV)暴发之后,爆发了中东呼吸系统综合症(MERS-CoV),人们对冠状病毒的科学兴趣增强。这是十年来的第一个CoV,名为2019-nCoV,来自中国武汉,并于2020年1月30日被世界卫生组织(WHO)宣布为“国际关注的公共卫生突发事件”。截至2020年2月4日,仅在中国报告了425例死亡,而在中国境外报告了1例死亡(菲律宾)。在短时间内,该病毒已在24个国家/地区传播。人畜共患疾病的传播(从动物到人)被怀疑是疾病的起源途径。遗传分析预测蝙蝠是2019-nCoV的最可能来源,尽管还需要进一步的研究以确认新病毒的来源。持续的nCoV爆发凸显了致命病毒的隐藏野生动物资源库,以及存在人畜共患病的潜在威胁。成功的病毒隔离尝试为开发更好的诊断方法和有效的疫苗打开了大门,有助于预防病毒向新区域的传播。

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  • 摘要:

    我们报告了中国深圳的2019-nCoV感染患者的流行病学,临床,实验室和放射学特征以及预测疾病严重程度的潜在生物标记物。 2019-nCoV感染的12例患者均患有肺炎,其中一半患有急性呼吸窘迫综合征(ARDS)。最常见的实验室异常是低白蛋白血症,淋巴细胞减少,淋巴细胞(LYM)和中性粒细胞(NEU)百分比降低,C反应蛋白(CRP)和乳酸脱氢酶(LDH)升高以及CD8计数降低。从患者呼吸道检测到的2019-nCoV病毒载量与肺部疾病严重程度呈正相关。 ALB,LYM,LYM(%),LDH,NEU(%)和CRP与急性肺损伤高度相关。年龄,病毒载量,肺损伤评分和血液生化指标,ALB,CRP,LDH,LYM(%),LYM和NEU(%)可能是疾病严重程度的预测指标。此外,来自2019-nCoV感染患者的血浆样本中的血管紧张素II水平显着升高,并且与病毒载量和肺损伤呈线性关系。我们的结果表明,有许多潜在的诊断生物标志物和血管紧张素受体阻滞剂(ARB)药物可用于重新治疗2019-nCoV感染。

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  • 摘要:

    我们旨在估算NCP在中国的基本和时变传播动态,并将其与SARS进行比较。我们从流行病学调查或官方网站收集到2020年2月7日的NCP病例数据。此外还获得了2002-2003年广东省,北京和香港的严重急性呼吸道综合症(SARS)病例的数据。我们估计了NCP和SARS的倍增时间,基本再现数(R0)和随时间变化的再现数(Rt)。截至2020年2月7日,中国共发现34598例NCP病例,2月4日以后每日确诊病例减少。全国NCP的倍增时间为2.4天,比广东省的SARS(14.3天)香港(5.7天)和北京(12.4天)的时间短。全国和武汉市非典病例的R0分别为4.5和4.4,高于广东(R0 = 2.3),香港(R0 = 2.3)和北京(R0 = 2.6)的SARS的R0。 广东省NCP继发病例的R0为0.6,在流行期间Rt值小于1。NCP可能具有比SARS更高的传播能力。

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    我们收集了截至2020年2月6日报告的实验室确诊NCIP病例的人口统计学特征,接触史和疾病时间表的信息。考虑到中国春节期间的大量人口迁移,采用Flow-SEIR模型实证分析。假设大多数人将从2月10日到2月底重返工作岗位,则根据确诊病例和春节期间的迁移数据,确定并估计即将从家中迁移到工作场所的风险。我们使用来自百度迁移的数据来估计即将在2020年2月10日至28日休假后返回工作场所的迁移。然后估算了返回的迁移风险。研究发现:(1)每天的新病例数量达到高峰水平的时间,即全国流行病拐点,预计将在2月7日至2月9日。在此拐点之后,感染人数将缓慢增长,疫情将逐渐蔓延。逐渐受到控制。湖北省确诊病例的预测峰值可达到62800。湖北的高峰时间是2月29日。除湖北以外地区的高峰到达时间将在2020年3月8日至3月15日之间。从高峰到疫情结束大约需要1.5-2个月。大多数省份的预测峰值低于1000。(2)湖北省的估计感染人数呈现较大的前倾和陡峭特征,而不是较大的爆发,显示出该流行趋势趋于一致的总体趋势。 (3)自我保护和隔离的必要意识对流行病的预防和控制非常有效。它可以减少近90%的患者人数。(4)流行病的预警非常重要。在实验环境中结果显示,如果及时将城市封锁提前1天,最终将减少3600人。如果有1天的延迟,最终将有大约1800人处于危险之中。(5)、假设假阴性率为50%,潜在传播率是确诊患者的1-4倍,那么患者的实际峰值人数可能在214400-472500之间。假设假阴性患者的传播率是确诊患者的两倍,如果假阴性率在一周内下降5%,那么高峰患者的数量将减慢11.62%。如果该比例在一周内下降10%,则高峰患者人数将下降21.91%,这表明及时发现假阴性人群对于控制流行病更为有效。(6)在自然条件下,春节运输的返回将加剧疫情,特别是对于广东,浙江,江苏,湖南,河南,上海,福建和北京。

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