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2020年第1期(发布时间: Feb 3, 2020 发布者:蒋君)  下载: 2020年第1期.doc       全选  导出
1   2020-02-03 16:30:44.62 武汉市应对2019年新型冠状病毒疫情出行限制的早期评估 (点击量:180)

一种新型冠状病毒(2019-nCoV)的持续爆发在中国首次报道,并已在全球蔓延。2020年1月23日,中国关闭了进出武汉的交通,这是一个1100万居民城市的主要交通枢纽,以控制疫情的爆发。通过结合流行病学和人口流动性数据,我们发现旅行禁令减缓了nCoV从武汉向中国其他城市扩散的2.91天(95%CI:2.54-3.29)。这一阻断为制定和加强其他控制措施提供了时间,而这些措施对制止这一流行病至关重要。2019-nCoV的持续传播可用来研究旅行限制如何阻碍新出现传染病的空间传播。

2   2020-02-03 16:27:54.44 2019-nCoV传输与控制的早期动力学:数学模型研究 (点击量:143)

截至2020年1月30日,2019-nCoV的爆发已导致7818例病例。了解感染的传播动态对于评估控制措施的可能有效性和新地区持续传播的可能性至关重要。我们将随机传播模型与武汉市2019-nCoV病例和武汉市输出病例的数据相结合,以估计传播随时间的变化,以及截至2020年1月23日该市症状病例的可能患病率。根据这些估计,我们计算了新引进病例在其他地区爆发的可能性。我们估计,从2020年12月中旬到1月中旬,R在1.6-2.9之间波动。我们发现,美国、澳大利亚和法国到武汉旅游史的确诊病例比模型预测的要多,并估计到2020年1月23日武汉实施旅游限制时,共有29500例(14300-85700)的症状病例流行。根据我们对R的估计,我们计算出,在与武汉有相似传播潜力的地区,一旦出现三个以上的病例,感染在该人群中建立的可能性将超过50%。我们的结果显示,2019-nCoV具有持续人传人的巨大潜力,在2020年1月23日实施旅行限制之前,武汉的出口病例可能有所增加。随着更多的病例到达国际其他地点,很可能许多传播链最初无法建立,但最终仍可能导致新的疫情爆发。

3   2020-02-02 15:40:05.64 中国武汉的2019-nCoV爆发的潜在国内和国际传播预测:一项模型研究 (点击量:148)

自2019年12月31日以来,中国武汉市报告了由2019年新型冠状病毒(2019-nCoV)引起的肺炎暴发。病毒已传播到中国其他城市以及国际上,有可能引发全球性疾病爆发。在此,研究人员根据从武汉输出到其他中国大陆城市的病例数来估算武汉市的流行病规模,并预测流行病在国内和全球范围内的公共卫生风险(包括社会和非公共卫生风险) -药物预防干预措施。

研究人员使用2019年12月31日至2020年1月28日从武汉输出到其他地方的病例数(已知症状发生日为2019年12月25日至2020年1月19日)来推断武汉市2019年12月1日到2020年1月25日的感染人数,然后对国内的病例进行估计。研究人员预测了2019-nCoV在全国和全球范围内的传播,并考虑到了从2020年1月23日至24日实施的武汉及周边城市隔离的影响。研究者使用了《官方航空指南》和腾讯数据库在中国大陆300多个地级市的人口流动数据。确诊病例的数据来自中国疾病预防控制中心发布的报告。连续时间间隔的估计是基于先前对严重急性呼吸系统综合症冠状病毒(SARS-CoV)的研究得出的。采用易感暴露的传染恢复集合种群模型模拟了我国各大城市的疫情。使用马尔可夫链蒙特卡罗方法估算基本生殖数,并使用所得的后验均值和95%可信区间(CrI)表示。

在基线方案中,研究人员估计2019-nCoV的基本生殖数量为2.68(95%CrI 2.47-2.86),并且已经感染了75,815人(95%CrI 37,304–130,330)。截至2020年1月25日,武汉的流行倍增时间为6.4天(95%的CrI 5.8-7.1)。在基线情况下,重庆,北京,上海,广州和深圳分别从武汉输入病例461例(95%CrI 227-805),113例(57-193),98例(49-168),111例(56-191)和80例(40–139)。如果2019-nCoV的可传播性在国内各地以及随着时间的推移都相似,则我们可以推断,中国多个主要城市的疫情已经呈指数增长,滞后于武汉爆发约1-2周。

鉴于2019-nCoV已不限于在武汉范围内传播,其他中国主要城市可能仍在继续局部爆发疫情。除非与人口和个人层面都实施实质性公共卫生干预措施,否则与中国有着紧密交通联系的海外大城市也可能成为爆发中心。由于大量的症状前病例输出和缺乏大规模公共卫生干预措施,全球主要城市的独立自我维持爆发可能不可避免。备灾计划和缓解措施应做好准备,以便在全球范围内快速部署。

4   2020-01-30 19:48:38.197 一项家庭聚类的研究表明2019年新型冠状病毒肺炎存在人与人之间的传播 (点击量:145)

LANCET柳叶刀1月24日在线发表来自中国香港大学研究者的论文,关于中国湖北省武汉市正在爆发的新型冠状病毒有关的肺炎。受影响的患者在地理上与当地的潜在市场联系在一起,成为潜在的来源。

在这项研究中,报告了一个家庭聚类中的五名患者的流行病学,临床,实验室,放射学和微生物学发现,他们在回访武汉后回到中国广东省深圳市后又出现了不明原因的肺炎,另外一个家庭成员没有去武汉。对这些患者的遗传序列进行了系统进化分析。从2020年1月10日开始,我们招募了一个在2019年12月29日至2020年1月4日期间从深圳前往武汉的6名患者家庭。在前往武汉的6名家庭成员中,有5名被确定感染了新型冠状病毒。此外,一名未到武汉的家庭成员在与四名家庭成员接触几天后被该病毒感染。尽管有两个人去过武汉的一家医院,但他们的家人都没有与武汉的市场或动物接触。暴露后3-6天,有5名家庭成员(年龄在36-66岁之间)出现发烧,上呼吸道或下呼吸道症状或腹泻,或出现这两种情况的组合。他们在症状发作后6-10天就诊到研究者所在的医院(香港大学深圳医院,深圳)。他们和一名无症状的儿童(10岁)有放射性玻璃底肺混浊。年龄较大的患者(年龄> 60岁)具有更多的全身症状,广泛的放射学玻璃样肺改变,淋巴细胞减少,血小板减少症以及C反应蛋白和乳酸脱氢酶水平升高。通过即时点多重RT-PCR,这6例患者的鼻咽或咽拭子对已知的呼吸道细菌呈阴性,但是5例(4个成年人和1个孩子)对编码内部RNA依赖性RNA的基因呈RT-PCR阳性Sanger测序证实了这种新型冠状病毒的聚合酶和表面穗蛋白。通过下一代测序对这五位患者的RT-PCR扩增子和两个完整基因组进行的系统进化分析表明,这是一种新型冠状病毒,与在中国马蹄蝠中发现的与蝙蝠严重急性呼吸综合征(SARS)相关的冠状病毒最接近。

5   2020-02-03 17:51:52.61 新型冠状病毒(2019-nCoV)感染死亡风险的实时估计:基于输出病例的推断 (点击量:5)

已确诊的2019新型冠状病毒(2019-nCoV)感染输出病例,为估计我国累积发病率和确诊病死风险(cCFR)提供了机会。了解cCFR对于描述2019-nCoV在流行早期的严重性和其流行潜力至关重要。利用发病率的指数增长率,本研究估计了cCFR和基本生殖数,即单纯人群中单个原发病例所产生的继发病例的平均数。截至2020年1月24日,共有23例输出病例,根据2019年12月8日的增长率估算(情景1),并利用输出病例增长以来的数据(情景2),中国的累计发病率分别为5433例(95%置信区间(95%置信区间:3883-7160)和17780例(95%置信区间:9646-28724)。情景1和情景2的cCFR最新估计分别为4.6%(95%CI:3.1-6.6)和7.7%(95%CI:4.9-11.3%)。情景1和情景2的基本生殖数分别为2.2(95%CI:2.1-2.3)和3.7(95%CI:3.1-4.3)。根据研究结果,我们注意到目前2019-nCoV疫情有可能引发大流行病。提出的方法可以仅使用公开可用的数据提供洞察早期风险评估。

6   2020-02-03 17:49:34.753 湖北省2019-nCOV疫情流行趋势模拟 (点击量:4)

截至2020年1月30日上午8时(北京时间),全世界约有8000例病例得到证实。需要模拟湖北省2019-nCOV疫情的流行趋势。通过SEIR模拟,预测湖北省疫情高峰将在2020年1月28日至2020年2月7日,总传染病例将达到7000-9000例。上述估计是基于一些假设和限制退出。

7   2020-02-03 17:46:48.737 中国2019-nCoV有效繁殖数估算 (点击量:3)

根据中国疾控中心每日报告的病例,我们估计了2019-nCoV的有效繁殖数量。本模型研究表明,2019-nCoV的有效繁殖数高于SARS,病死率相当。

8   2020-02-03 17:44:37.807 旅客筛查预防2019年新型冠状病毒国际传播的效果评估(2019-nCoV) (点击量:4)

最近出现了2019株新型冠状病毒(nCoV),旅客筛查正被用于限制其进一步全球传播。在这里,我们考虑到关键的nCoV生命史和流行病学参数值的不确定性,分析了不同的旅行筛查计划的预期影响。即使在最佳情况假设下,我们估计筛查也会漏掉一半左右的受感染旅客。分解导致筛查成功和失败的因素,我们发现大多数筛查漏掉的病例基本上是无法检测到的,因为他们还没有出现症状,也不知道暴露在外。这些研究结果强调,有必要采取措施,追踪那些在旅行筛选后生病的旅客。我们使模型可供交互使用,这样涉众可以使用最新的信息探索感兴趣的场景。我们希望这些发现有助于以证据为基础的政策,以打击nCoV的传播,并有助于未来的规划,以减轻未来出现的病原体。

9   2020-02-03 17:42:07.53 一种新型传染病的实时流行病学鉴定:武汉市2019-20年非典型肺炎疫情分析 (点击量:8)

目的:病毒学检测表明,一种新型冠状病毒是武汉市2019-20年肺炎爆发的最可能原因。我们证明,在进行病毒学检测之前,非病毒学描述特征可以确定该肺炎暴发是由一种新的病原体引起的。

方法:从两个医学社交媒体网站实时收集疫情特征,比较可以引起非典型肺炎的十个现有病原体特征。目前的暴发是由“X病”(即以前未知的病因)引起的,而不是由一种已知的病原体引起的,这一估计是随着暴发的继续而更新的。

结果:在病毒鉴定前一周,即2019年12月31日,X病引发疫情的概率被评估为32%以上。在2020年1月5日通过实验室检测排除了一些特定病原体后,推断X病的概率超过59%。

结论:我们从数量上证明了非典型肺炎的暴发与一种新病原体的致病性是一致的。该方法仅使用常规观察到的非病毒学数据,即使在病毒学检测结果可用之前,也可以帮助进行风险评估。

10   2020-02-03 16:33:41.9 机场筛查在检测2019-nCoV感染旅客中的效果 (点击量:10)

随着中国国内外新型冠状病毒病例数量的增长,公共卫生当局需要证据证明机场入境人员热筛查等控制措施的有效性。我们评估了2019-nCoV感染的出入境筛查的有效性。在我们的基线情景中,我们估计感染的旅客的46.5%(95% CI:35.9到57.7)将不被检测到,这取决于潜伏期、出入境筛查的敏感性以及无症状病例的比例。机场检查不太可能检测到足够比例的2019-nCoV感染旅客,以避免感染旅客入境。我们开发了一个在线工具,以便在获得新信息时更新结果。