目录
2016年第6期(发布时间: Jul 27, 2016 发布者:丁倩)  下载: 2016年第6期.doc       全选  导出
1   2016-06-30 15:46:37.367 国际食品信息委员会调查:美国人仍对转基因标识的看法存有分歧 (点击量:7)

国际食品信息委员会2016年食品与健康调查显示:史无前例的转基因标识法将于2016年7月1日在佛蒙特州正式生效,在此前夕,美国人仍对转基因标识与其在食品供应中使用的看法存在分歧。此外,国际食品信息委员会将数据进行可视化展示。

美国人对现行的转基因标识政策感情复杂。目前,美国食品药品监督管理局要求,只有当转基因食品与同种非转基因食品存在实质性差异时才需要标识,例如存在营养差异或潜在过敏原。然而,将此政策推广至标识所有转基因食品仍有很多分歧。

对此问题存在很高的不确定性。28%的人不确定现行政策是否应该推广至标识所有转基因食品。就美国本国而言,44%的美国人支持标识所有转基因食品。

存在微小的区域差异。美国中西部地区(25%)最支持美国食品药品监督管理局现行的标识政策,最多的反对者来自南部(8%)。

当问到美国人对转基因在食品供应中使用的看法时,回答也各不相同。就美国本国而言,51%的美国人或不确定,或没有偏好。转基因用于食品的最多反对者来自西部(33%),最多支持者来自东北部(21%)。

“从我们的研究来看,关于转基因,需要提供给消费者更多的教育和宣传机会,”国际食品信息委员会主席Kimberly Reed说,“根据美国国家科学院最近发表的一份报告,对健康潜在或不利的影响,转基因作物与非转基因作物相比没有差异。换言之,转基因作物与其同类非转基因作物一样安全。”

尽管44%的消费者支持扩大转基因标识,但实际上他们中很少人避开转基因或寻找非转基因标识。就美国本国而言,对于避开或购买转基因食品,多数消费者或不确定或没有偏好(42%)。只有大约1/3(34%)的消费者试图避开转基因食品。

尽管对转基因食品的看法存在分歧,大多数美国人(66%)对美国食品供应的安全性有信心。只有7%的人没有信心。美国中西部地区对食品供应最有信心,15%的人“非常有信心”。西部地区信心最低,30%的人“很少或没有信心”。

2   2016-07-04 11:11:11.52 利用单分子长读取测序揭示玉米转录组的复杂性 (点击量:8)

玉米是阐明转录网络的重要遗传模型。mRNA转录的完整结构的不确定性限制了对该系统的研究进展。本研究利用单分子测序技术,在6个组织中产生111151个转录,这些组织能获取约70%的玉米RefGen_v3基因组注释基因。很大比例的转录(57%)代表新型的,有时组织特异性,已知基因的亚型和3%对应于新基因位点。在其他情况下,确定的转录会改进现有的基因模型。平均在六个组织中,90%的剪接点由匹配组织的短读取维持。此外,我们确定了大量新型的长非编码RNA和融合转录,并发现DNA甲基化对产生不同亚型起重要作用。研究结果表明,玉米B73转录组的特性描述研究还远远没有完成,玉米的基因表达远比以前认为的更复杂。

3   2016-07-04 15:17:38.427 小麦的干旱响应转录因子WRKY的TaWRKY1和TaWRKY33基因赋予拟南芥抗旱性和抗热性 (点击量:9)

背景

干旱胁迫是造成农作物损失的主要原因之一。作为最大转录因子家族之一的WRKY转录因子,在许多植物的生理过程调节中起重要作用,包括干旱胁迫响应。然而,关于三大主要粮食作物之一的小麦的干旱响应WRKY基因信息很少。

结果

比较小麦转录组测序数据(无论是否进行干旱处理),鉴定出48个干旱诱导WRKY基因,并对挑选的TaWRKY1和TaWRKY33作进一步研究。亚细胞定位分析表明TaWRKY1和TaWRKY33定位在小麦叶肉原生质核。发现TaWRKY1和TaWRKY33的启动子中存在许多非生物胁迫相关元素。定量实时PCR分析表明,TaWRKY1在高温和脱落酸条件下表达上调,低温下调。TaWRKY33参与温度、脱落酸和茉莉酸甲酯响应。在多种胁迫下的拟南芥中,TaWRKY1和TaWRKY33的超表达激活多个胁迫相关的下游基因,提高发芽率,促进根系生长。在脱水条件下,TaWRKY33转基因拟南芥还表现出失水率低于TaWRKY1转基因拟南芥和野生型拟南芥。最重要的是,TaWRKY33转基因株系抗热性能增强。

结论

功能作用突出WRKY在胁迫响应中的重要性。

4   2016-07-07 17:27:31.83 羊驼朊病毒蛋白基因的遗传突变 (点击量:1)

传染性海绵状脑病(又称朊病毒病)是人畜共患的致命神经退行性疾病。朊病毒病主体是折叠状的朊病毒蛋白,能抵抗宿主细胞的分解。由于所有哺乳动物都在各种细胞(如神经元)上表达朊病毒蛋白,所以理论上,所有哺乳动物都能感染朊病毒病。举个例子,牛海绵状脑病(又称疯牛病)已被证实能感染牛、羊、外来波动、猫、非人类的灵长类动物以及人类,当新宿主食用被病原污染的饲料或食物时。羊驼在北美洲用于生产纤维,可能接触到感染朊病毒病的动物或处于朊病毒污染的环境中。目前尚无北美洲驯养或野生羊驼可抵抗现有朊病毒病的研究报告。朊病毒蛋白特定位置的氨基酸侵袭会导致其他物种的脆弱性。本研究旨在确定羊驼朊病毒蛋白的氨基酸序列,并与其他驯养动物的已知序列进行比较。在本研究中,羊驼序列与骆驼、羊、牛和鹿的序列高度相似。在十处有羊驼独有的朊病毒氨基酸序列变异(多态性),包括两个氨基酸缺失和一个插入。其他研究人员可使用本研究结果进行朊病毒蛋白的结构建模,进而确定朊病毒蛋白基因致使羊驼患朊病毒病的机理。

5   2016-07-08 16:26:08.667 水稻遗传转化中的选择标记——植物磷酸甘露糖异构酶(PMI) (点击量:2)

EcPMI基因被广泛用作基于植物遗传转化的甘露糖选择的选择标记基因(SMG)。虽然一些植物表现出显著的PMI活动,甚至在甘露糖敏感植物中发现活性PMI,但是植物PMI是否能用作SMG还尚不清楚。在本研究中,我们从小球藻和水稻中分离出四种新的PMI基因,评估了他们的体外同功酶活性,并与EcPMI的同功酶活性比较。活性的植物PMI作为SMG分别构建在双元载体中,然后通过土壤杆菌转入水稻。在籼稻和粳稻中,我们的研究结果表明通过与EcPMI相似的模式,植物PMI可以选择和产生转基因植物。转基因植物表现出植物PMI转录累积和体内PMI活性增强。此外,使用植物PMI作为SMG成功将感兴趣的基因转入水稻。因此,从植物中分离出甘露糖选择的新SMG,我们的分析表明,编码活性酶的PMI可能在植物共有,可能在同源转基因工程中被用作遗传成分。

6   2016-07-20 16:28:06.2 同源四倍体和二倍体水稻中花粉发育的小分子RNA的比较分析 (点击量:1)

MicroRNAs (miRNAs)在植物生殖中起重要作用。然而,关于同源四倍体水稻microRNAome分析的研究相当有限。此处在二倍体和多倍体水稻花粉发育时采用高通量测序技术分析microRNAomes。与二倍体水稻相比,同源四倍体水稻中共检测出172种差异表达的miRNAs(DEM),57种miRNAs在同源四倍体水稻中特异性表达。在这172种DEM中,115种miRNAs上调,61种miRNAs下调。上调DEM的靶基因本体分析表明,它们富集在减数分裂前间期的膜运输、减数分裂繁殖和单小孢子阶段的核苷酸结合中。osa-miR5788和osa-miR1432-5p_R+1在减数分裂中上调,它们的靶基因揭示了减数分裂相关基因的相互作用,它们可能参与染色体行为相关的基因调控。在同源四倍体水稻的花粉发育中发现了丰富的与转座因子相关的24 nt siRNA,但是它们在二倍体水稻中的含量明显下降,这表明24 nt siRNA在花粉发育中可能发挥作用。对于多倍体在花粉发育中对小分子RNA表达模式的影响并导致同源四倍体水稻花粉不育,这些发现提供了认识的基础。

7   2016-07-22 11:41:30.967 高海拔哺乳动物瘤胃微生物的趋同进化 (点击量:1)

进化生物学的中心焦点遗传适应性的研究大多数集中在宿主的基因组上,只有很少一部分关注协同进化的微生物。青藏高原是人类和其他哺乳动物最极端的生存环境之一。牦牛和藏绵羊都对这严峻的高海拔环境有适应性。适应性进化影响能量代谢相关的基因,以帮助这些反刍动物在高海拔条件下生存。本文研究了瘤胃微生物的趋同进化,其能使牦牛和藏绵羊——两种典型高海拔反刍动物持久收集能量。与低海拔的牛和普通山羊相比,牦牛和藏绵羊的甲烷产出水平较低,挥发性脂肪酸(VFA)较高。超深宏基因组测序揭示了瘤胃微生物基因的VFA通路显著富集在高海拔反刍动物中,而甲烷通路富集在牛的宏基因组中。RNA的转录组分析揭示了高海拔反刍动物瘤胃上皮中与VFA运输和吸收相关的36个基因显著上调。我们的研究为微生物推动哺乳动物的适应性进化提供了新的视角,揭示家畜温室气体排放的生物防治。

8   2016-07-27 11:14:07.443 OsSRT1在水稻种子发育过程中调控淀粉代谢基因表达 (点击量:5)

水稻组蛋白去乙酰化酶OsSRT1与人类SIRT6基因密切相关,在基因组稳定性和新陈代谢稳态中发挥重要作用。本文研究了OsSRT1在水稻种子发育中的作用。OsSRT1的下调诱导了水稻淀粉调节子1和淀粉酶基因在发育种子中的高表达,引起淀粉合成下降,淀粉降解上升,导致种子发育异常。染色质免疫沉淀分析表明OsSRT1能降低发育种子中组蛋白H3K9在淀粉代谢基因和转座子中的乙酰化作用。此外,OsSRT1直接与淀粉代谢基因相关,例如OsAmy3B、OsAmy3E、OsBmy4和OsBmy9。研究结果显示介导的组蛋白去乙酰化OsSRT1参与淀粉积累和转座子抑制,以调节种子的正常发育。