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2017年第6期(发布时间: Jun 30, 2017 发布者:赵华)  下载: 2017年第6期.doc       全选  导出
1   2017-06-23 10:46:54.267 农业生物技术创新——消费者在水稻生产中对局部RNA干扰技术的购买意向 (点击量:14)

为检验非转基因局部RNA干扰技术在昆虫防治中的市场前景,分别在美国,加拿大,澳大利亚,法国以及比利时进行相关“支付意愿(WTP)”调查,以了解消费者在以下两种抗虫害水稻品种的购买中是否需要相应的溢价或优惠政策:1)在传统水稻基因序列中加入苏云金芽孢杆菌基因(Bt)的转基因水稻;2)使用局部RNA干扰喷雾的非转基因水稻。此次调查设计基于MPL格式,以便被调查者可以选择自己更能接受的在水稻中的昆虫防治技术,例如:常规的利用苏云金芽胞杆菌基因的转基因技术以及不同价位的非转基因RNA干扰技术。利用区间回归模型对调查结果进行数据分析,以生成针对每个可控人口变量的国家的“支付意愿”的溢价或优惠。此外,调研了消费者意愿消费的分别由转基因技术和RNA干扰技术生产的食物,并且利用McNemar配对法对每个国家的支付意愿的差异进行检验评估。研究结果表明:(1)相对于购买传统生产的水稻,在购买局部RNA干扰技术生产的水稻时,美国,加拿大,澳大利亚和法国的消费者仍需要一定的优惠政策(p<0.5);(2)美国,加拿大,澳大利亚,法国以及比利时的消费者在购买Bt转基因水稻时比购买局部RNA干扰技术生产的水稻需要额外30%~40%的优惠(p<0.5);(3)所有被调查国家的消费者都对局部RNA干扰技术生产的水稻更有购买意愿(p<0.5)。这些结果均表明:了解了这两种不同的生物技术,相比于转基因杀虫剂,消费者更偏向于利用RNA干扰技术来控制虫害。

2   2017-06-23 10:58:27.453 基于液滴微流控编码技术下的超高通量单细胞基因测序法 (点击量:8)

在大细胞群的单细胞分离过程中,由于技术上存在着极大的挑战,单细胞基因组测序技术的应用也因此受到一定的阻碍。本文提出的单细胞基因测序法,利用液滴微流控技术将大细胞群中的单细胞进行分离、独立,并进行编码后,使用Illumina基因测序。在超高通量基因测序过程中,以革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌的共生群落为实验对象,单组测序可一次通过超过50000个单细胞。同时,测序完成的基因组将基于特征序列在硅胶片中进行识别分类。基于这种超高通量单细胞基因测序法,我们分析了环境微生物样品基因中的抗生素抗性基因、毒力因子以及噬菌体序列的分布情况。而且,此技术对于常规的大细胞群的单细胞基因测序能力,可以对不同类型的大细胞群体的遗传异质性进行去卷积化处理。

3   2017-06-29 18:14:43.307 从单细胞RNA拓扑序列分析揭示细胞分化和发育机理 (点击量:11)

在细胞发育过程中,基因转录操控着细胞的谱系定向和细胞分化。通过对单细胞RNA序列的研究,可以对细胞命运有一个很好的认识。但是,就数据结构来讲,这种研究方法又受到当前分析假设方法的限制。为此,我们提出了一种基于拓扑计算的数据分析方法——单细胞拓扑数据分析法(scTDA),通过这种方法,我们对短暂无偏差的转录调控进行研究。与其他数据分析方法不同的是,scTDA法是一种非线性的,基于独立模型的聚类数据网络结构,可以生动描绘瞬时细胞状态。为研究运动神经细胞分化诱导因子,我们利用scTDA法研究了小鼠体外干细胞分化过程。而且基于转录因子,RNA结合蛋白和长非编码RNA(lncRNAs)的阶段性组合的变化,scTDA法分为随时间变化的细胞个体的不同步和连续性,并以此来鉴定了四种瞬时状态(全能性细胞,前体细胞,祖细胞和完全分化的细胞)。利用scTDA数据分析方法,可以研究异步细胞对发育信号和环境扰动因子的反应。

4   2017-06-29 18:16:55.597 蓝莓DDF1基因的过表达对提高其耐寒性的研究 (点击量:12)

从目前研究中可知,在木本植物中,基因CBF与DREB1的表达会增加植物个体的耐寒能力,而且还可能会导致植物矮化和花期延迟。同样,拟南芥DDF1基因在过表达时植物个体在耐寒性上也会有一定的提高。然而,到目前为止,在木本植物的研究中还未发现DDF1的同源基因。

密歇根州立大学的宋国庆研究了DDF1基因在蓝莓中的过表达。研究发现,VcDDF1基因的过表达会增强四倍体蓝莓个体的耐寒性,但不会对植株大小和花期造成显著的改变。同时,分析研究了转基因与非转基因的蓝莓在低温应答、花期、Della蛋白以及植物激素方面的差异表达基因。

研究结果表明,蓝莓耐寒性能的提升,与冷调控基因和乙烯传导途径基因的表达有关。而由于基因VcDDF1-OX对DELLA蛋白质合成、花期以及其他植物激素基因表达的调控影响甚微,因此蓝莓植株的大小、休眠期以及花期均无太大改变。此外,在植物生长素和细胞分裂素的合成途径中的差异性表达基因也同样显示出基因过表达对植物耐旱性和耐盐性能力的改变。

因此,VcDDF1基因以及其同源基因的过表达可作为提高木本植物耐寒性的一种新方法。

为获取更多研究信息,请参阅 BMC Plant Biology。

5   2017-06-29 18:18:55.107 基于特定类型远程染色体组装技术的六倍体小麦基因的快速克隆 (点击量:7)

一些谷类作物如小麦和玉米因存在着大量的重复基因,这就增加了个体基因克隆的难度。此外,在同一谷物中的四类品种的基因排序有着显著差异。目前,谷类作物基因克隆技术最大的挑战在于如何从目标品种当中获取高质量的遗传编码信息。为提高各品类小麦的基因克隆技术,我们研究提出了基于染色体的远程组装(TACCA)技术。基因克隆TACCA组装技术利用染色体流式分选法将复杂的基因进行降解,然后将其与芝加哥远程联动5号基因进行组装。仅仅用了四个月的时间,我们利用TACCA组装技术重新克隆装配了高质量的小麦CH Campala Lr22a品系的染色体。而且,通过基因重新组装,我们在新个体基因中克隆了广谱Lr22a叶锈病抗性基因,而且在使用分子标记和甲磺酸乙酯(EMS)突变体时,发现了Lr22a能够编码与拟南芥RPM1蛋白同源的胞内免疫受体。

6   2017-06-29 18:20:54.947 研究人员破解了植物细胞壁的遗传密码 (点击量:19)

目前,为提高植物性食品的质量,来自纽约大学和quadram生物研究所的科研人员解开了植物细胞壁的遗传密码。研究团队利用DNA微阵列技术分析研究了数千种植物细胞样品,并收集了与细胞排列相关的大量数据。并且,他们利用关联定位法将这些信息与不同品种植物细胞之间遗传信息的特殊变化联系了起来。

纽约大学的Ian Bancroft博士解释说:“植物细胞壁由碳水化合物组成,而且通过这些不碳水化合物巧妙而重要的排列顺序,可以用以确定细胞壁的性质。” 另外,他补充道,细胞壁中碳水化合物的改变,会造成植物特性的改变,包括植物个体的生长及对病虫害的防御。而且,这些改变也同样会影响产品的实用特性,如营养品质和生物可燃性。

“更好地对植物细胞壁合成的遗传控制进行研究了解,我们可以更加有效地改善农业和生物产业的发展”,Ian Bancroft博士如是说。微阵列技术的应用有助于识别标本中的遗传基因标记(标记可能含有更多或更少的特定成分)。当培育人员确定良性基因变体存在时,科学家可以通过突出显示的标记物来确定相关基因的可能的位置和种类。

获取更多信息,请关注相关研究报道University of York website。